Este hospital se considera el primer centro de slud fundado en la Nueva Guatemala de la Asunción, en octubre de 1778. Su ubicación siempre ha sido en la 1a. avenida y 11 calle de la zona 1.
Entre 1801 y 1862 estuvo administrado por la asociación religiosa laica Hermandad de la Caridad; más se parecía a un mercado que a un servicio de salud.
Ahora
El nuevo edificio del Hospital San Juan de Dios fue inaugurado el 23 de marzo de 1983, en el ligar que antes ocupara. Se considera que es el nosocomio más grande de toda la república, pero también se dice que, pese a lo colosal de su estructura, la atención que presta después pasó a ser atendido por la orden religiosa Hermanas de la Caridad de San Vicente de Paúl.
En 1873 fue denominado Hospital General, y desde 1968 se le llama Hospital General San Juan de Dios.
Este edificio quedó destruido por el terremoto del 4 de febrero de 1976 y su población interna fue trasladada, de manera provisional, al parque de La Industria.
Ante tal emergencia, los pacientes quedaron siete años hacinados en este improvisado hospital que no satisface las necesidades médicas de la población, y las instalaciones empiezan a ser insuficientes.
ps no soy del san juan pero no tengo nada en contra del mismo, pienso q es buen hospital, tiene buena escuela y todo, anq desde q en el IGSS habemos tan buenos internistas pienso q ahora si tienen competencia...